三栋屋是典型的客家围村，于一七八六年由陈姓客家人建立。陈氏家族于十八世纪中期从广东移居本港，择居荃湾，并且填平沿海的土地作耕种之用。三栋屋原先只有三列房舍，由族长陈任盛所建，他的后人先后在村的两旁及后面加建房舍。位于中轴线上的正厅，摆放了陈氏先祖的神位，面向正门，正门石楣上刻有「陈氏家祠」四字。三栋屋于一九八七年全面复修，竣工后成为三栋屋博物馆，开放予市民参观。
三栋屋村于一九八一年列为古迹。
