二帝書院位於元朗錦田水頭村，由鄧二帝會於清朝道光年間（一八二一至一八五○年）集資興建。該會由十六名鄧族的顯赫士紳組成。二帝書院供奉原先放置於附近一座文昌塔內的文昌帝和關帝像，書院亦因而得名。書院其後成為一所重要學府，不少著名學者亦曾在此講學。
二十世紀初推行現代教育，二帝書院亦轉為一所小學，約有學生三十人。書院於第二次世界大戰後停用。
書院是一所兩進式建築物，呈長方形，以青磚及夯土建成，外有圍牆，圍牆兩端均設入口。可能基於風水原因，書院正門建於兩進之間，有別於一般書院的布局。書院正門外的前院以白石鋪砌，稱為「白石巷」。二帝書院的全面修復工程於一九九四年底竣工。
二帝書院於一九九二年列為古蹟。
［平面圖］
