三棟屋是典型的客家圍村,於一七八六年由陳姓客家人建立。陳氏家族於十八世紀中期從廣東移居本港,擇居荃灣,並且填平沿海的土地作耕種之用。三棟屋原先只有三列房舍,由族長陳任盛所建,他的後人先後在村的兩旁及後面加建房舍。位於中軸線上的正廳,擺放了陳氏先祖的神位,面向正門,正門石楣上刻有「陳氏家祠」四字。三棟屋於一九八七年全面復修,竣工後成為三棟屋博物館,開放予市民參觀。
三棟屋村於一九八一年列為古蹟。